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来源 | 南湖新闻网

近日,华中农业大学农业微生物学国家重点实验室、植物科学技术学院陈小林课题组在New Phytologist发表了题为MTA1-mediated RNA m6A modification regulates autophagy and is required for infection of the rice blast fungus的研究论文。该研究以稻瘟菌-水稻为模式系统,揭示了N6-甲基腺苷修饰 (N6-methyladenosine RNA, m6A) 调控植物病原真菌侵染结构功能的新机制。


RNA m6A修饰是真核生物中mRNA最普遍的修饰,近年来在人类,动物,植物和酵母等物种中均被发现广泛参与不同的生物学过程,在不同的生物体内均发挥着关键调控作用。在这些物种中,METTL3/IME4是m6A甲基化转移酶复合体中一个最重要的组成蛋白,主要负责催化RNA分子在N6-甲基腺嘌呤上发生m6A修饰。然而,由于在丝状真菌中一直未发现与METTL3/IME4同源的蛋白,因此m6A修饰在植物病原真菌中是否存在并发挥功能,一直未得到系统的研究。本研究中,研究者鉴定到一个与人类METTL4 (通常被认为编码DNA 6mA修饰的关键酶) 同源的蛋白MTA1,随后证明该蛋白参与稻瘟菌RNA m6A修饰 (但可能并不参与DNA 6mA修饰) 。

MTA1基因敲除后导致稻瘟菌总m6A修饰显著降低,同时病菌致病力严重降低。进一步分析发现,致病力降低是由于敲除体附着胞功能受到影响,同时侵染菌丝扩展能力也受到抑制。敲除体附着胞形成过程中,糖原和脂质体利用能力显著受限,细胞自噬过程受阻,同时附着胞膨压显著降低。由于MTA1在附着胞中发挥关键作用,随后收集野生型和MTA1敲除体的附着胞材料,进行MeRIP-seq和RNAseq联合分析。与野生型菌株比较发现,MeRIP seq分析在Δmta1菌株的附着胞中鉴定出595个mRNA的659个位点m6A甲基化水平降低。其中,糖类代谢和脂类代谢,以及细胞自噬相关的信号通路被富集。结合RNAseq数据,发现其中的114个m6A修饰水平与mRNA丰度呈负相关,暗示m6A修饰可能参与mRNA的降解 。

进一步分析表明,一些调控细胞自噬过程的ATG基因的转录本受到m6A修饰,包括ATG8。通过网站预测到ATG8的转录本3’非翻译区位点A982可能为m6A修饰位点,随后将该位点进行了点突变。MeRIP-qPCR分析表明,A982位点突变导致ATG8 m6A修饰水平严重降低;同时qRT-PCR分析表明A982位点突变导致ATG8 mRNA水平升高,表明m6A负调控ATG8的mRNA丰度。A982位点突变后,同时导致ATG8蛋白水平升高,附着胞细胞自噬过程紊乱,从而影响附着胞功能,导致致病力减弱。综合以上研究发现,在稻瘟菌附着胞形成过程中,m6A修饰可能参与细胞自噬蛋白mRNA丰度的调控,从而协调附着胞细胞自噬,调控功能性附着胞的形成,帮助稻瘟菌致病 (图1) 。


图1. 稻瘟菌m6A修饰调控机制模式图

综上所述,该研究首次系统揭示了RNA m6A修饰调控植物病原真菌过程的分子机制,为深入理解植物病原真菌的致病机理提供了新的视角,可能为开发真菌病害防控策略提供新的思路,为研发新的杀菌剂提供新的候选靶标。

华中农业大学植物科学技术学院博士研究生任智勇和英国The Sainsbury Laboratory唐博增博士为共同第一作者,华中农业大学陈小林教授为通讯作者。华中农业大学黄俊斌教授,郑露副教授,刘浩副教授,以及湖南杂交水稻研究中心邢俊杰研究员也参与了该研究。研究得到国家自然科学基金资助。

论文链接:

https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/nph.18117

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